Ekspresi Relatif mRNA LMP1 Epstein-Barr Virus dari Jaringan Tumor Terfiksasi Formalin dalam Blok Parafin sebagai Biomarker Progresivitas Tumor pada Karsinoma Nasofaring Tidak Berdiferensiasi

Abstract

Abstract
Nasopharyngeal carcinoma (NPC) is a multifactorial disease that is geographically endemic in the world. Indonesia population is about 225 million people having varied diversity ethnic and has the high incidence rate of NPC approximately 6.2 per 100,000 people per year. EBV infection has been shown to be consistent with the onset of NPC. The pathogenesis of NPC is more directly reflected by carcinoma-specific viral transcriptional activity at the site of primary tumor. Therefore, EBV infection in NPC is also reflected by the expression of EBV latent and lytic gene, particularly in the expression of mRNA LMP1 EBV as a biomarker for EBV latent infection. The aims of this study were to determine the relative expression of mRNA LMP1 EBV in undifferentiated NPC (NPC WHO-III) patient as a biomarker of tumour progressivity in NPC. The samples were the tissue biopsies formalin-fixed embedded paraffin (FFPE) of 28 undifferentiated NPC patients at Pathology Anatomy Departement, R.S.U.D. Prof. dr. Margono Soekarjo, Purwokerto. The relative expression of mRNA LMP1 EBV was determined by RT-qPCR technique and calculated by formula 2-ΔCt. The relative expression of mRNA LMP1 EBV in undifferentiated NPCpatients on advanced staging was approximately start from 5,832.90 to 39,786.70. In undifferentiated NPC patients, the relative expression of mRNA LMP1 EBV in stadium IV (13.619,33 + 4902,3) increased of 1.5 times compared to stadium III (n = 2; 9.299,35 + 6178,9), however it was no significance differences statistically. Therefore, the relative expression of mRNA LMP1 EBV has a potensial biomarker of tumour progressivity in advanced staging undifferentiated NPC.

Abstrak
Karsinoma Nasofaring (KNF) merupakan penyakit yang bersifat multifaktor dan endemik di dunia. Populasi penduduk Indonesia yang berjumlah 225 juta yang terdiri atas beragam etnis populasi memiliki laju insidensi kasus KNF yang tinggi berkisar 6,2 per 100.000 penduduk pertahun. Infeksi EBV terbukti konsisten dengan perkembangan KNF. Patogenesis KNF lebih nyata terlihat dari aktivitas spesifik transkripsi virus pada tumor primernya. Infeksi EBV pada KNF dapat diamati dari ekspresi gen laten dan litiknya.. LMP1 merupakan onkogen utama dalam tumorigenesis KNF, sehingga ekspresi mRNA LMP1 EBV berperan sebagai petanda biologi infeksi laten EBV. Penelitian ini adalah untuk mengetahui ekspresi relatif mRNA LMP1 EBV berpotensi sebagai biomarka progresivitas tumor pada KNF tidak berdiferensiasi (KNF WHO III) Desain penelitian ini adalah studi cross sectional (seran lintang). Subyek penelitian adalah 28 biopsi jaringan tumor nasofaring yang terfiksasi dalam blok paraffin (formalin-fixed paraffin embedded/FFPE) populasi pasien KNF tidak berdiferensiasi pada Poli Patologi Anatomi R.S.U.D. Prof dr. Margono Soekarjo – Fakultas Kedokteran Unsoed, Purwokerto. Ekspresi relatif mRNA LMP1 EBV ditentukan dengan teknik RT-qPCR dan dihitung dengan rumus 2-ΔCt. Nilai ekspresi relatif mRNA LMP1 EBV pada penderita KNF tidak berdiferensiasi stadium lanjut berkisar 5,832.90 - 39,786.70. Nilai ekspresi relatif mRNA LMP1 EBV pada stadium IV (13.619,33 + 4902,3) meningkat 1,5 kali dibandingkan dengan stadium III (9.299,35 + 6178,9), namun peningkatan ekspresi relatif mRNA LMP1 EBV tidak bermakna secara statistik Ekspresi relatif mRNA LMP1 EBV dari biopsi jaringan tumor FFPE berpotensi sebagai biomarka progresivitas tumor pada stadium lanjut KNF tidak berdiferensiasi.